空间转录组学
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结合空间转录组数据与组织学图像,获得可解释的高分辨率表征。
- 多模态学习
- 多个空间转录组数据集的整合
研究 / 开源软件
我参与开发的单细胞与空间组学分析软件,代码和使用文档均已开源。
空间转录组学
结合空间转录组数据与组织学图像,获得可解释的高分辨率表征。
单细胞数据整合
用矩阵分解方法,联合分析来自不同疾病阶段、治疗组或发育阶段的单细胞样本。
自适应聚类
利用变分自编码器学习细胞表征,并通过自适应簇合并不断更新聚类结果。
图表征学习
利用图自编码器,从细胞—基因二部图中学习细胞与基因的低维表征。